Родился 11 мая 1969 года в селе Каинда Кеминского района Чуйской области. По национальности кыргыз, имеет два высших образования, доктор политических наук. Женат, отец четверых детей.
В 1987-1989 годах проходил воинскую службу в рядах Вооруженных сил СССР.
В 1993 году окончил с отличием отделение журналистики филологического факультета Кыргызского государственного университета.
В 1998 году с отличием окончил Российскую академию государственной службы (РАГС) при Президенте Российской Федерации по специальности «Политология».
В 2002 году защитил в Москве (РАГС) кандидатскую диссертацию, а в 2010 году защитил докторскую диссертацию в Дипакадемии при Министерстве иностранных дел Российской Федерации.
Трудовую деятельность начал в 1992 году в качестве корреспондента независимой газеты «Асаба», где работал до 1994 года.
В 1994-1995 годах – референт пресс-службы, в январе 1996 года назначен на должность руководителя пресс-службы, с июля 1996 по декабрь 1999 года – Пресс-секретарь Президента Кыргызской Республики.
С декабря 1999 года по декабрь 2004 года – Президент АО «Учкун».
В 2000-2005 годах – депутат Собрания народных представителей Жогорку Кенеша Кыргызской Республики II созыва по Джальскому округу № 2 г.Бишкек, член Комитета по международным и межпарламентским связям.
В феврале 2005 года был избран депутатом Жогорку Кенеша Кыргызской Республики III созыва по Аламудунскому избирательному округу № 62. Является автором ряда законопроектов.
В 2002 году Межпарламентская ассамблея СНГ наградила К.Иманалиева орденом «Содружество», Золотой медалью «Древо дружбы».
Каныбек Иманалиев – известный в республике журналист, публицист. Он автор книг: «Кыргызстан (Слово о Родине)», изданной на русском, английском, немецком и китайском языках, «Жоогазын ыры» («Тюльпаны пустыни»), «Саякбай», «Кыргызские притчи», «Алтынколдун аккуусу», «Тагай бий», «Шабдан баатыр» и сборника стихов «Арзуу ыры». Он также является составителем 14-томного издания «Кыргыздар», в котором собраны сведения и статьи об истории, культуре, этнографии кыргызского народа.
В 2009 году его книга «Каганат» (Сокровенное сказание кочевников) был награжден Дипломом І степени в номинации «Наш современник» на международном конкурсе государств-участников стран СНГ.
С декабря 2008 по ноябрь 2010 г. проректор Кыргызско-Российского Славянского Университета по международным связям.
С 2010 по 2015 – год депутат Жогорку Кенеша Кыргызской Республики V созыва от партии «Ар-Намыс», председатель комитета по международным делам.
С октября 2015 года депутат Жогорку Кенеша Кыргызской Республики VI созыва от партии «Ата-Мекен», заместитель председателя Комитета по международным делам, обороне и безопасности.